Al mismo tiempo, es una de las seis agrupaciones regionales con representación en la Alianza Bautista Mundial.
Su sede central se encuentra en la ciudad de Ámsterdam, Países Bajos.
La FBE fue fundada en la ciudad de Rüschlikon, Suiza en el año 1949.
[1] Desde 1990, la afiliación a la Federación ha ido en continuo aumento hasta abarcar prácticamente a cada país de Europa y también cinco uniones bautistas en el Medio Oriente.
Ese mismo año, participó en la fundación del Centro Internacional de Estudios Teológicos Bautistas en Rüschlikon, Suiza.