Fdupes es un programa para escanear directorios en busca de ficheros duplicados, con opciones para listarlos y borrarlos.
Primero compara los tamaños de los ficheros y firmas MD5, y después realiza una verificación byte-a-byte.
fdupes está escrito en C y liberado bajo la Licencia MIT.
Otros programas que pueden encontrar duplicados y funciona bajo *nix: