En 1977, esta definición fue actualizada por Peter Gund a "un conjunto de rasgos estructurales en una molécula que es reconocida en un sitio receptor y es responsable para la actividad biológica de esa molécula" (Gund.[1] En la química computacional moderna, los farmacóforos se usan para definir los rasgos esenciales de una o más moléculas con la misma actividad biológica.Una base de datos de diversos compuestos químicos puede ser explorada por más moléculas que exhiben los mismos rasgos localizados a una distancia similar que los aparta en forma mutua.Los rasgos necesitan para emparejar diferentes grupos químicos con propiedades, para identificar ligandos noveles.Un modelo farmacóforo bien definido incluye volúmenes hidrofóbicos y vectores puente hidrógenos.
