En 1944 cambiaron su nombre por el de FC Lyuboslav y contrataron al entrenador húngaro Kramer Lipot, el cual fue despedido más tarde por los malos resultados.

El club más adelante desaparecería, pero fue restablecido en 1958 por las autoridades comunistas de Burgas con todos los logros obtenidos anteriormente, aunque fue con el nombre SC Botev en honor al héroe nacional de Bulgaria Hristo Botev.

Varios años después, las autoridades de la ciudad decidieron volver a llamar al club Chernomorets.

Los mejores años del club fueron a inicios de los años 1980s, sobre todo en la temporada 1981/82, en la cual terminaron en el quinto lugar y jugó en 31 temporadas en la A PFG.

[2]​ En el 2005 teniendo como presidente a Ivaylo Drazhev, el club se declaró en bancarrota y el Chernomorets fue relegado al tercer nivel de Bulgaria, y antes de iniciar la temporada 2006-07 el club desapareció por problemas financieros, dejando un record negativo como el peor equipo en la historia del fútbol mundial en Primera División al completar 43 fechas consecutivas con derrotas, sin obtener un solo punto en su última temporada como equipo deportivo.