Comprende 54 especies descritas y de estas, solo 45 aceptadas.

[2]​ El género fue descrito por Robert Brown y publicado en Chloris Melvilliana 9–10, pl.

[3]​ Eutrema: nombre genérico que se deriva de la combinación de los vocablos griegos εὐ (eu); "bien, bueno", y τρῆμα (trêma); "agujero"; "buen agujero", en referencia a la perforación que producen en el septo del fruto, las especies del género.

[4]​ A continuación se brinda un listado de las especies del género Eutrema aceptadas actualmente, ordenadas alfabéticamente.

Para cada una se indica el nombre binomial seguido del autor, abreviado según las convenciones y usos.