La estación de Wynigen fue abierta en el año 1857 con la apertura al tráfico ferroviario del tramo Berna - Herzogenbuchsee de la línea Berna - Olten, que unos meses más tarde con la inauguración del tramo Herzogenbuchsee - Olten hizo que se completara la línea.
La estación se encuentra ubicada en la zona suroeste del núcleo urbano de Wynigen.
Tiene un total de dos andenes, ambos laterales y dos vías pasantes.
La estación está situada en términos ferroviarios en la línea férrea Berna - Olten.
Los servicios son prestados por SBB-CFF-FFS, que ofrece conexiones de ámbito regional: