[3]​ Dicha estación, que sustituía otra anterior provisional, se inauguró en el año 1876 y pasó rápidamente a ser gestionada por la Compañía de los Ferrocarriles Andaluces, ya que esta se hizo con la línea férrea en 1877.

Tres Alvia diarios en ambos sentidos con parada en la estación unen El Puerto de Santa María con Cádiz y Madrid pasando por Sevilla, Córdoba o Ciudad Real.

La estación dispone de enlace directo con Barcelona mediante el InterCity Torre del Oro, que recupera desde 2021 la conexión cubierta por el Tren hotel hasta 2010.

Todos los trenes MD de la línea 65 que opera Renfe se detienen en la estación.

Los fines de semana y festivos sólo circula un tren por hora en toda la línea.