Las instalaciones estuvieron operativas entre 1901 y 1985, fecha en que se clausuró el trazado ferroviario de Calatayud-Caminreal.
En la actualidad el antiguo complejo se encuentra sin uso.
La estación de Báguena entró en servicio en junio de 1901, con la inauguración del tramo Calatayud-Puerto Escandón de la línea que pretendía unir Calatayud con Valencia a través de Teruel y Sagunto.
No obstante, el resto del trazado no sería inaugurado en su totalidad hasta 1902.
[1] Las obras corrieron a cargo de la Compañía del Ferrocarril Central de Aragón.