La parte superior del escudo lleva un casco del tipo español en tiempo de la conquista, representando el paso de Sebastián de Benalcázar por tierras zapotillanas, desde los andes bajos hacia la conquista del Reino de Quito, por esto bien podrían decir los zapotillanos que San Sebastián de Zapotillo, como lo bautizaron los españoles, fue el primer pueblo fundado en lo que hoy es el territorio ecuatoriano.

En el contorno del escudo se aprecia la bandera del Ecuador significando la soberanía de un pueblo que geográficamente está rodeado por territorio peruano y sin embargo ha estado siempre presto a la defensa de sus fronteras Norte, Sur y Oeste.

Dentro del escudo se pueden observar seis divisiones o cuarteles: El escudo descansa sobre una cinta, en la que se puede leer CANTÓN ZAPOTILLO, con los colores de la bandera del Cantón en la que están grabadas las fechas 1534 de su fundación y 1980 de su cantonización [1]​