Los escamosos machos tienen hemipenes, que generalmente se mantienen invertidos dentro de sus cuerpos y se evierten para la reproducción a través del tejido eréctil como el del pene de los mamíferos.A menudo lleva espinas o ganchos, para anclar al macho dentro de la hembra.[2] Los escamosos aparecieron a finales del Triásico y constituyen un grupo más antiguo de lo que suponía; no obstante, ninguna de las familias actuales es muy anterior al Cretácico; la primera serpiente es del Cretácico Superior y el grupo no parece haberse diversificado hasta el Oligoceno.Los estudios genéticos revelan las siguientes relaciones filogenéticas para los escamosos con respecto a otros reptiles y tetrápodos vivos (incluido las secuencias proteicas obtenidas de Tyrannosaurus rex y Brachylophosaurus canadensis).[6][7][8][9] Amphibia Mammalia Sphenodontia Squamata Testudines Crocodilia Aves Tyrannosauroidea (Tyrannosaurus) Ornithischia (Brachylophosaurus) Los análisis genéticos han demostrado que los lagartos son un taxón parafilético que representa el grado temprano de los escamosos, ya que de diferentes tipos de lagartos se originarían las serpientes (Serpentes) y las culebrillas ciegas (Amphisbaenia).La filogenia de los escamosos entre familias es la siguiente:[3][4][5] Dibamidae Diplodactylidae Pygopodidae Carphodactylidae Eublepharidae Sphaerodactylidae Phyllodactylidae Gekkonidae Scincidae Xantusiidae Gerrhosauridae Cordylidae Gymnophthalmidae Teiidae Lacertidae Rhineuridae Bipedidae Blanidae Cadeidae Trogonophidae Amphisbaenidae Shinisauridae Lanthanotidae Varanidae Helodermatidae Xenosauridae Diploglossidae Anniellidae Anguidae Chamaeleonidae Agamidae Leiocephalidae Iguanidae Hoplocercidae Crotaphytidae Corytophanidae Tropiduridae Phrynosomatidae Dactyloidae Polychrotidae Liolaemidae Leiosauridae Opluridae Anomalepididae Leptotyphlopidae Gerrhopilidae Xenotyphlopidae Typhlopidae Aniliidae Tropidophiidae Uropeltidae Anomochilidae Cylindrophiidae Xenopeltidae Loxocemidae Pythonidae Boidae Xenophidiidae Bolyeriidae Acrochordidae Xenodermidae Pareidae Viperidae Homalopsidae Colubridae Lamprophiidae Elapidae