Luego logró exiliarse a Turquía, donde trabajó como profesor de urbanismo.
Su gran popularidad se convirtió en 1948 en una victoria electoral sin precedentes del SPD, que consiguió el 64,5% de los votos al parlamento de los sectores occidentales la ciudad, el mejor resultado jamás conseguido por un partido alemán en unas elecciones libres a nivel regional.
Pese a esta mayoría aplastente, a causa de la situación política peligrosa, Reuter formó un gobierno de coalición con la Unión Demócrata Cristiana (CDU) y el partido liberal LDP (que luego se unió con el FDP).
En 1949, Reuter obtuvo el doctorado honoris causa de la Universidad Libre.
El 17 de abril de 1953, se creó la Fundación Alcalde Reuter, que apoyaba a los refugiados que venían a Berlín occidental desde la RDA.