Allí pasa 3 meses en Misiones colectando plantas, ayudado grandemente por la colonia sueca que se había establecido en esa área.

En el mismo año se suponía que partiera en la tercera expedición Regnelliana a Sudamérica.

Ekman fue enterrado en Santiago de los Caballeros donde también fueron erigidas una estatua y una placa para honrarlo.

Describió más de 2000 especies nuevas para la ciencia (una gran cantidad de las cuales fueron nombradas con su nombre), más notorio esto dado que por ese periodo se consideraba que la flora caribeña estaba bastante bien documentada.

Sus colecciones son usadas todavía muy activamente en la investigación sobre la flora de las Antillas.

Un trabajo biográfico sobre Ekman está en realización (autores Thomas A. Zanoni (Nueva York) y Roger Lundin (Suecia).