En 1681, visita Upsala en Suecia, donde se le ofrece asentarse; pero él desea seguir viaje; será secretario de Embajada, donde Carlos XI lo envía a Rusia y al Imperio persa en 1683.

En ruta a Japón, su barco toca Siam, cuya capital visita; registrando su encuentro con el ministro plenipotenciario siamés en Francia, Kosa Pan.

Kaempfer permanece dos años en Japón, durante los cuales visita dos veces Edo y al Shōgun Tokugawa Tsunayoshi.

Compra su semilla y las plantará a su regreso en el jardín botánico de Utrecht, donde aún hoy se pueden admirar.

En Alemania publica el libro Amoenitatum exoticarum (Lemgo, 1712) donde muestra una ilustración de una camelia e introduce 23 variedades.

Además estaba una Historia de Japón, traducido del manuscrito al inglés por J.Scheuchzer (1684-1738) y publicados en Londres, en 2 vols., en 1727.