La transmisión del virus parece ser casi siempre vectorial, en Europa fundamentalmente por las garrapatas (Ixodes ricinus).

[4]​ Existen tres variedades: la europea, la del Lejano Oriente y la siberiana.

[5]​ La encefalitis verno-estival rusa (meningoencefalitis verno estival, MEVE) y la encefalitis de Europa Central son dos enfermedades causadas por dos subtipos del mismo virus, que son sin embargo diferentes, tanto por la intensidad del cuadro clínico como por el vector o la especificidad antigénica y el análisis molecular del virus.

[9]​ La ex Unión Soviética ha realizado un importante esfuerzo de investigación sobre todas las enfermedades transmitidas por garrapatas, incluido el virus TBEV.

Además, existe una vacuna eficaz y bien tolerada que se comercializa en ciertos países.