[1]​ Comenzó la temporada 2013/14 con Atenas de San Carlos en Segunda División.

Debutó como profesional el 23 de noviembre de 2013, en un enfrentamiento contra Huracán, ingresó en sustitución de Maximiliano Sigales y ganaron 2 a 0.

Para la temporada 2014/15, consiguieron su ascenso a Primera División.

Debutó en Primera División el 14 de febrero de 2015 en el partido ante River Plate, ingresó al minuto 17 en reemplazo de Hernán Petryk y ganaron 5 a 2.

El 2 de enero de 2019, Emiliano fue anunciado como fichaje del Juticalpa, como refuerzo para afrontar el Torneo Clausura 2019 en Honduras.