Kautzsch estudió "Teología y Estudios Orientales" en la Universidad de Leipzig, en cuya facultad teológica recibió su doctorado en filosofía en 1863, fue nombrado profesor asociado en 1869 y catedrático en 1871.
La edición alemana de los Apócrifos y Seudoepígrafos del Antiguo Testamento (1898-1900), que también proporcionó, serviría como suplemento a esa Biblia y fue una obra de referencia hasta finales del siglo XX.
También publicó la Enciclopedia y Metodología de las Ciencias Teológicas de Karl Rudolf Hagenbach (siglos X y XI).
Los hijos de Kautzsch, Rudolf (1868-1945) y Paul (1882-1958) eran historiadores del arte.
Su hija Johanna (1878-1964) se casó con el matemático Ernst Richard Neumann .