Defendió los títulos seis veces antes de perder ante Wilfredo Vázquez en 1996 por TKO en una pelea que lideraba en todas las tarjetas.
[1] Rojas nunca volvió a competir por un título mundial, y se retiró en 2005 después de una derrota ante Herman Ngoudjo.
Permaneció invicto durante 22 peleas, antes que Young Kyun Park lo derrotara por decisión unánime en su primer intento por conseguir el título mundial AMB que poseía Park, Sin embargo posteriormente obtendría la revancha, ganándola por decisión dividida adjudicándose así el título mundial AMB del Peso pluma.
Rojas finalmente perdería su título mundial por nocaut técnico en 11 asaltos ante Wilfredo Vazquez.
Eloy Rojas terminó su carrera profesional con un récord de 47 peleas, 40 victorias, 5 derrotas y 2 empates.