El diario El Territorio renovó su imagen en el año 1996.
Actualmente, es distribuido en la provincia de Misiones y el norte correntino.
En 1999, fue creado el territoriodigital.com, que es el primer periódico en línea de la provincia de Misiones y depende exclusivamente de los contenidos del diario.
En 2014 cambió el nombre de su sitio web a El Territorio, para unificar la marca de sus versiones impresas y digitales.
A través del sitio web, se elige a la reina virtual del Inmigrante, durante cada edición de la Fiesta del Inmigrante, en la ciudad de Oberá.