Es conocido por ser el receptor personal del lanzador Greg Maddux durante su estadía como jugador con los Bravos.Formó parte del equipo que ganó la Serie Mundial de 1995, pero no llegó a participar en ningún encuentro.Ese mismo año en Venezuela fue objeto de un cambio donde pasaba de los Tigres de Aragua a las Águilas del Zulia junto con el jardinero Felipe Jiménez y el lanzador Fernando Mejías (luego dejado en libertad) por Pedro Castellano, Carlos Quintana (dejado libre al poco tiempo) y Blas Cedeño.Pérez conectó un grand slam en el octavo episodio del definitivo Juego 3 de la serie.En el Juego 2 conectó un jonrón de dos carreras en la sexta entrada que rompió un empate 2-2.[8] En mayo de 2000, Pérez sufrió un desgarro del manguito rotador y perdió toda la temporada.[9] Volvió a lesionarse el mismo hombro en marzo de 2001 y sólo apareció en 5 partidos esa temporada.Pérez se convirtió en prescindible después de que los Bravos adquirieron al receptor Henry Blanco.[11] Pérez pasó la temporada 2002 como suplente de Einar Díaz y se le concedió la agencia libre al final del año.Jugó ese año compartiendo la posición con Keith Osik, siendo titular en tres de cada cinco juegos.El mánager Bobby Cox nombró a Pérez como su preparador de bullpen para la temporada 2007.