[1]​ Tener dientes diferentes, una condición llamada heterodoncia, es raro entre los reptiles modernos pero era común entre los pterosaurios primitivos.

[1]​ El quinto dígito de sus miembros posteriores era inusualmente largo y orientado hacia los lados.

Los fósiles fueron estudiados por Christian Erich Hermann von Meyer en 1831[4]​ y de nuevo por Theodori en 1852 cuando él los refirió al género Rhamphorhynchus.

[5]​ En este período se asumió que tenía una cercana afinidad con un pterosaurio descubierto en Gran Bretaña, más tarde denominado Dimorphodon.

[8]​ Desde entonces se han hallado restos mucho más completos en otras localidades alemanas sobre todo en Württemberg, incluyendo Holzmaden, Ohmden y Zell.

Debido a la excelente preservación de los últimos hallazgos fósiles, Dorygnathus ha generado un considerable interés para los expertos en pterosaurios, destacándose los importantes estudios dedicados a esta especie realizados por Felix Plieninger,[11]​ Gustav von Arthaber,[12]​ y más recientemente Kevin Padian.

No se encuentra ninguna cresta ósea en la recta parte superior del cráneo y el hocico.

La mandíbula inferior es delgada en la parte posterior pero se vuelve más alta hacia el frente en donde se fusionan ambas mitades en la sínfisis que acaba en una punta desdentada que le da su nombre al género.

Las primeras cinco o seis cortas vértebras caudales formaban la base flexible de la cola.

El esternón es triangular y relativamente pequeño; Padian ha sugerido que puede haberse extendido hacia atrás con un tejido cartilaginoso.

Los tres primeros metacarpianos están conectados a tres pequeños dedos, equipados con garras cortas y muy curvadas; el cuarto por su parte se conectaba al dedo alar, en el cual la segunda o tercera falange es la más larga; la primera o cuarta es la más corta.

Se han preservado en algunos especímenes partes blandas, pero estás son raras y limitadas, por lo que proveen poca información acerca de su naturaleza.

Se desconoce si la cola poseía una estructura en forma de diamante en su final, como ocurre en Rhamphorhynchus.

Por tanto él concluyó que D. mistelgauensis es un sinónimo más moderno subjetivo de D. banthensis.

En tierra, Dorygnathus era probablemente un mal trepador; sus garras no muestran adaptaciones especiales para ese tipo de locomoción.