Estuvo participando varias temporadas hasta lograr el título de la Departamental del Callao en 1984 y con ello el club pasó a la Etapa Regional de la Copa Perú 1985.

Durante su paso en la División Intermedia y Segunda División, se rivalizó a otros clubes populares chalacos tales como Sport Boys , Grumete Medina y Atlético Chalaco.

Luego con equipos nuevos como Deportivo CITEN y Hijos de Yurimaguas.

Luego de perder la categoría, el Deportivo Enapu retornó a la Copa Perú.

En 1993 participó en el Etapa Departamental del Callao donde finalizó en el último lugar y al año siguiente dejó de competir tras no presentarse en el torneo distrital.