La población creció sostenidamente llegando a ser mayoría en la ciudad hasta que a mediados del Siglo XIX una epidemia de cólera devastó la ciudad y por muertes o emigración la población judía, dos tercios de la total, se redujo de 630 a 330 familias.

[3]​ En 1903 la creciente hostilidad de la población musulmana y el deterioro de su posición económica llevaron a la comunidad judía de Debdou a solicitar y obtener asistencia financiera de la Alliance Israélite Universelle con sede en París.

[3]​ Si bien la creación del protectorado francés en 1912 eliminó los problemas de seguridad de la comunidad, la población judía emigró gradualmente a las cercanas ciudades.

Pese a ello, hasta mediados de la década del 50 Debdou mantuvo su posición central en la vida del judaísmo maghrebi.

Tras la Segunda Guerra Mundial, un millar de judíos continuaban en la ciudad.