Aunque los obreros del textil no se habían unido todavía al LRC, Shackleton fue nombrado como su candidato para las elecciones parciales celebradas en Clitheroe en 1902.
Philip Snowden, que había sido considerado como candidato por el Partido Laborista Independiente, se retiró de la pugna.
Los liberales y los conservadores también se retiraron, percibiendo el fuerte liderazgo de Shackleton.
Shackleton ejerció como presidente del Partido Laborista Parlamentario durante un periodo de tiempo.
Fue elegido presidente del Trades Union Congress en 1906, manteniendo su poderosa posición en el movimiento sindical.