Bernstein es el autor de los programas informáticos qmail, publicfile y djbdns.

Es graduado en matemáticas por la Universidad de Nueva York (1991), y un doctorado también en matemáticas por la Universidad de California, Berkeley (1995), donde le tutorizó sus estudio Hendrik Lenstra.

La educación secundaria la cursó en Bellport, un colegio público de Long Island.

Bernstein propuso Internet Mail 2000 como sistema alternativo de correo electrónico para sustituir a Simple Mail Transfer Protocol (SMTP), Post Office Protocol (POP3) e Internet Message Access Protocol (IMAP).

[1]​ En 2009 propuso DNSCurve, una mejora al sistema DNS que utiliza criptografía de curva elíptica para cifrar los paquetes de datos entre el cliente y el resolver DNS, entregando así confidencialidad, integridad y disponibilidad de la información.