El objetivo principal del juego es finalizar la historia tras coleccionar cada uno de los Custom Robos, las partes para batalla y otras cosas útiles para el jugador, mientras se gana cada batalla que hace al jugador avanzar dentro de la historia.
Existen seis maneras en las que un Custom Robo puede aterrizar luego de ser lanzado por un Robocannon.
Los Custom Robos se ordenan en grupos que son similares a sus habilidades.
Luego de que se levanta, el Custom Robo entra al modo "renacimiento", donde permanece invencible por 3 segundos.
Custom Robo V2 vendió 62.558 copias durante su primera semana de ventas en Japón.