Los conos permanecen cerrados durante muchos años, abriéndose sólo después de que el árbol padre perezca en un incendio forestal, permitiendo entonces a las semillas colonizar el terreno desnudo expuesto por el fuego.
Los conos masculinos tienen 3-5 mm de largo, y liberan polen en febrero-marzo.
Cupressus guadalupensis ha sido previamente considerada como sinónimo de Cupressus forbesii, que había sido incluida como una variedad de C. guadalupensis en el pasado.
Análisis recientes, sin embargo, han ubicado C. forbesii como una especie separada, aunque estrechamente relacionada.
guadalupensis: epíteto geográfico que alude a su localización en isla Guadalupe.