Con el Rojo obtuvo la Copa Sudamericana en diciembre del mismo año contra el Goiás de Brasil.

Jugando la Copa Libertadores 2011 para el Rojo, anota un gol saliendo del círculo central contra Peñarol de Uruguay.

Una temporada después, el Club Tijuana tuvo su primera participación en su historia en la Copa Libertadores, en la cual llegaron a cuartos de final para ser eliminados por el Atlético Mineiro dramáticamente, por un penal fallado por Duvier Riascos en el minuto 90 que les pudo haber dado el pase a las semifinales.

En el Clausura 2014, el Club Tijuana logró su calificación a la Liguilla de la Liga MX por tercera vez en su historia, comandados por Cristian Pellerano, quien anotó 7 goles en el torneo.

Cristian es hermano del futbolista Hernán Pellerano que juega en San Martín de Tucumán e hijo del exfutbolista de River Plate y Argentinos Juniors Ricardo Pellerano.