La Copa de Brasil 1999 fue la décima primera edición de la Copa de Brasil, competición nacional organizada por la Confederación Brasileña de Fútbol.

Participaron clubes de las primeras divisiones y otros regionales.

[2]​ El campeón del torneo fue el Juventude de la ciudad de Caxias do Sul, después de haber ganado 2-1 al Botafogo.

Los máximos goleadores de la copa de Brasil 1999 fueron Romário y Dejan Petković con 7 goles.

[1]​ En el torneo se jugaron 116 partidos y se marcaron 370 goles.