La Copa RFEF actual, fue creada en 1993 y no es considerada por la RFEF como la original, que se disputó entre los años 1944 y 1953, solo jugándose en la última edición una fase clasificaría mediante una liguilla, que comprendía a toda Andalucía que fue ganada por el Xerez Club Deportivo.
Actualmente ningún club campeón de la fase regional ha conseguido ganar la Copa de la RFEF, siendo lo más lejos que han conseguido llegar a los cuartos de final que fueron respectivamente la UD Los Palacios, el CD Alcalá y el Betis Deportivo Balompié, aunque cabe destacar que en la temporada 1953-54, tras decidir la RFEF, que la competición no se disputaría ese año las federaciones autonómicas de Andalucía, País Vasco, Extremadura, Castilla y León, Aragón, Cantabria y el Protectorado de Marruecos se pusieron de acuerdo unilateralmete, para celebrar el campeonato, ganando el Real Betis tras vencer por 3-2 al vigente campeón el Real Valladolid, pero por desgracia dicho campeonato nunca fue reconocido por la RFEF como un campeonato oficial.
El número de eliminatorias es según el número de equipos participantes, siendo todos los partidos a ida y vuelta y en caso de empate se va los penaltis a excepción de la final que si hay prórroga y después si el partido no se resuelve a los penaltis.
En la siguiente tabla se muestran todos los clubes que han disputado alguna vez una final.
Aparecen ordenados por número de títulos conquistados.