El torneo empezó el 15 de marzo de 1959 y concluyó el 26 de abril de ese mismo año en Ciudad de México, en el cual el Club Zacatepec logró el título por segunda vez con una victoria sobre el equipo del León FC de 1-0.

En esta edición se jugaron rondas eliminatorias entre los 14 equipos.

[1]​ Se utilizó un modelo tradicional de eliminación directa, donde el equipo con mayor número de goles en el marcador global avanzaba a la siguiente ronda.

Cada ronda se jugó a dos partidos, de visita recíproca.

En caso de haya empate, se define con un tiempo extra y en caso de percistir, se llevará a cabo unos tiros desde el punto penal, que solamente lo pateará un jugador por bando.