[1]​ Siete años después lo ocuparían la hermandad de los franciscanos.

Fue utilizado como hospital y almacén por los franceses durante la guerra de la Convención quienes posteriormente lo saquearon llevándose una gran cantidad de reliquias traídas desde Flandes por su fundador.

La primera tiene una planta de cruz latina con los brazos del crucero cortos y anchos.

Las numerosas reformas realizadas hace que sea un conjunto complejo de difícil adscripción estilística.

[1]​ Destaca el tríptico flamenco firmado por Antonio Blocklandt en 1577 que se representa lo siguiente En 1830 fue reformado y en 1959 se amplía la nave de la iglesia con la anexión de una ala del claustro y del patio y se construyó la fachada actual.