La Confederación de Sistemas Independientes (en la versión original inglesa: Confederacy of Independent Systems o CIS), también conocida como La Alianza Separatista o Separatistas, es una organización política ficticia que aparece en el universo ficticio de Star Wars, agrupando los planetas que querían liberarse de la República Galáctica y que fue apoyada por numerosas organizaciones relacionadas al comercio y las finanzas.
Fundada en el 24 ABY, la Confederación de Sistemas Independientes estaba compuesta por organizaciones pequeñas y sistemas estelares enteros que tenían la intención de abandonar la República Galáctica y crear un nuevo gobierno.
Miles de sistemas decidieron abandonar la República, liderados por el Conde Dooku, un ex-jedi, desencantado con la Orden.
Pero lo que parecía ser una crisis política era en realidad algo peor: en Geonosis, Dooku se reunió con jefes de poderosos grupos de comercio galáctico, que le prometieron sus ejércitos y créditos para su causa.
Los líderes de la alianza separatista fueron ejecutados en Mustafar en el 19 ABY, y los grupos comerciales que habían apoyado la causa se convirtieron en parte del nuevo Imperio, que nació de la antigua República.