Durante el desarrollo del equipo se le llamó A3500 y al salir el A3000 no se terminaron de eliminar las referencias al 3500 en los manuales impresos, lo que obligó a Commodore a acelerar el proceso.Además internamente tiene dos bahías adicionales de 5 1/4.Todas las bahías son de media altura.El Amiga Unix es una opción que se entrega primero en formato cinta y luego en CD-ROM Puede incrementarse la memoria Fast RAM añadiendo chips ZIP DRAM, que son notoriamente difíciles de fijar (y ahora de encontrar), y están disponibles en dos variedades, Page Mode o Static Column.Además de la versión estándar se vendió una versión acelerada, con la aceleradora Commodore A3640 equipada con un Motorola 68040 a 25 MHz en el slot de procesador, y con el 68030 y el coprocesador eliminados , y la unidad de disquete sustituida por una de alta densidad, que daba un formato de 1.76 MB (contra los 1.44 del PC) y es capaz de leer/escribir discos en formato PC.
