El Commodore 4040 es el reemplazo de los modelos anteriores 2040 (Estados Unidos) Y 3040 (Europa) con una versión actualizada del Commodore DOS, en lugar de la versión 1.0 de estas últimas.

Utiliza una forma de caja ancha y la interfaz paralela IEEE-488 común a las computadoras Commodore PET/CBM.

Estos modelos de unidad utilizan un formato de almacenamiento de datos de disquete de una sola densidad y una sola cara, similar al utilizado por las unidades Commodore 1540 y 1541, pero con un marcador de datos ligeramente diferente que indica qué modelo originalmente formateó el disco.

El esquema Group Coded Recording (GCR) de codificación binaria se utiliza para almacenar datos en el disco magnético.

Comenzando con la unidad Commodore 2040, esto le permitió a Commodore almacenar 170 kB en un disquete estándar de una sola cara y densidad simple de 5,25".