Los comahuesúquidos (Comahuesuchidae) son una familia de arcosaurios mesoeucocodrilios notosuquios, que vivieron desde el Aptiense hasta el Santoniense, en África y Sudamérica.

Comahuesuchus es homónimo del clado Comahuesuchidae.

Sereno y otros[1]​ sugirieron que Comahuesuchus y Anatosuchus eran ambos comahuesúquidos, pero el trabajo de Martinelli y Andrade y otros,[2]​ ha sugerido que A. minor no es un comahuesúquido.

Es probable que Comahuesuchus estuviera más estrechamente vinculado a Mariliasuchus.