Fue fundado en 1921 y a partir de la temporada 2024-25 jugará en la Primeira Liga, la primera categoría del fútbol en Portugal.[3] El equipo obtuvo una plaza en las categorías inferiores nacionales en 1979, y al final de la temporada 1985/86 consiguió el ascenso a Segunda División, en la que solo permanecería un curso.Manuel Fernandes volvió al banquillo el curso 2001/02 y los azorianos se hicieron fuertes en casa para salvarse con un 14º puesto.Además se disputó la Copa Intertoto de la UEFA 2002, con una eliminación en segunda ronda a manos del F.K.El equipo nacional portugués también ha utilizado el estadio para jugar partidos amistosos (el último fue una victoria 2-0 sobre Egipto, a una multitud agotada).
Pauleta
jugó para el Santa Clara en 1991 antes de militar en clubes más importantes donde se convertiría en uno de los mejores delanteros de Portugal de todos los tiempos.
