Por tradición en la capital de la provincia han existido varios equipos que los representaba en los torneos de Segunda Categoría y ese club sobre todo es el Club Social Cultural y Deportivo Malta Shungo, pero desde el año 2004 es donde se decide crear otro club para que representa al cantón y a la ciudad, tras realizar los trámites pertinentes en la Federación Ecuatoriana de Fútbol, a principios del 2004 ya se formó jurídicamente el club, pero es desde 2010 donde en la provincia se juegan torneos de segunda.
Es así como en 2010 su ilusión de jugar un torneo profesional se hace realidad siendo el unos de los 4 equipos en inscribirse en ese torneo, el Campeonato 2010 pasará a la historia del club porque en ese torneo el club consigue su primera victoria y sus primeros puntos en la era profesional, dejando en claro la intención de representar muy bien a la ciudad, cantón y provincia, pero no se dieron los resultados esperados, las diferentes derrotas sufridas le impidieron llegar a la siguiente etapa que es el zonal de ascenso.
Pero para la temporada 2015 la historia cambia y momento importante en la historia del club es su primera clasificación para representar a la provincia de Napo en los Zonales de la Segunda Categoría 2015.
La intención del club es trabajar con jugadores jóvenes[4] que ganen experiencia para poder formar un gran equipo.
Hubo jugadores que se destacaron en este torneo zonal de ascenso la mayoría menores de edad procedentes de las canteras del equipo, entre ellos están: Jerson Guaraca, Victor Mastián, Wellington Pavón, Joseph Valencia, Ángel Estacio, y Kevin Caiza, quienes se convirtieron en la base titular del equipo.