Los primeros jugadores que defendieron los colores de Alianza fueron: Wilberto Chávez, Énner Mina, César Caicedo, Félix Chang, Pablo Estupiñán, Cledys Chávez (+), Wálter Garcés, Fausto Bayas, Jorge Montaño, Grimio Ruano, entre otros.

En la nueva etapa se cambia el nombre de Alianza S.C.

por el de Nuevo Alianza, Club que luego se transformaría en el actual Alianza del Pailón, con vida jurídica, iniciando sus participaciones en los campeonatos de Segunda Categoría del fútbol profesional esmeraldeño, en 2004.

La idea la proponen Mauricio Garrido, Gustavo Samaniego, Jorge Nevárez y otros dirigentes y socios de la gloriosa institución deportiva, que en poco tiempo se ganó el aprecio y cariño de la hinchada sanlorenceña.

Para la temporada 2015 el equipo logra la clasificación una vez más después de 3 años a la fase zonal, en el torneo provincial 2015 finalizó en el 2° lugar del cuadrangular final detrás del Esmeraldas Petrolero.