Su padre Serafín Álvarez y su madre Felipa emigraron de España con su pequeño hijo Clemente en 1873, al principio del reinado de Alfonso XII, que puso fin a la Primera República Española y dio paso al período conocido como Restauración, situación que obligó a la familia a exiliarse debido a sus ideales antimonárquicos.
En estos países Clemente Álvarez estudió con clínicos notables de la época.
La primera de sus ocho hijos, María Elena, nació en Berlín en 1900.
[3] La experiencia adquirida en Europa sobre las prácticas de higiene y su preocupación por la problemática de la tuberculosis derivaron en su activa participación en la creación de la Liga Argentina Contra la Tuberculosis en 1901 y la instalación del primer Dispensario Antituberculoso en 1903.
[4] En 1910 participó en la fundación del Círculo Médico de Rosario, creando la Revista Científica del Círculo que dirigió durante 32 años.