Fue bisnieto del paisajista francés Esteban Boutelou I, famoso por su trabajo en Aranjuez, donde fue jardinero mayor desde 1716, y La Granja, y nieto de Esteban Boutelou II, quien sucedió a su padre en Aranjuez.

[1]​ Mediante una pensión real estudió en Francia e Inglaterra agricultura y horticultura, junto con su hermano.

[2]​ En 1807 ingresó en el Jardín Botánico de Madrid, espacio que llegó a dirigir y donde ejerció la docencia hasta su expulsión del jardín en 1814 por su condición de afrancesado.

Trabajó abundantemente en agronomía, como por ejemplo con el «trillo de ruedas» que en la antigüedad era conocido como Plostellum punicum; definiéndolo a ese instrumento agrícola propio del área mediterránea como:

En honor a los dos hermanos, se nombra al género: