Se casó en segundas nupcias con Augusto el Joven, entonces señor de Hitzacker y que desde 1635 será príncipe de Brunswick-Wolfenbüttel, aunque ella nuca será princesa consorte al fallecer antes.

Nacida en Franzburg, era el segundo vástago e hija mayor del duque Bogislao XIII de Pomerania-Barth con su primera esposa, Clara de Brunswick-Luneburgo.

En Barth el 7 de octubre de 1593, Clara María se casó por primera vez con Segismundo Augusto, hijo menor del duque Juan Alberto I de Mecklemburgo-Schwerin.

Tuvieron dos hijos:[1]​ Clara María murió en Hitzacker a la edad de 48 años sin descendencia sobreviviente.

Fue enterrada en la Iglesia de la Ciudad (Stadtkirche) en Dannenberg.