A lo largo de su carrera profesional ha trabajado con artistas como The Beatles, Pink Floyd, Queen, Sex Pistols, Roxy Music, Badfinger, Elton John, Paul McCartney, Pete Townshend, INXS, Pulp, The Pretenders y U2.

[2]​ Sin embargo, tras varios años de actividad, Thomas decidió que tenía poco interés en hacer carrera como músico profesional.

A mitad de las sesiones, Martin decidió tomarse unas vacaciones y propuso que Thomas asumiera sus deberes como productor.

En el libro "The Beatles: Recording Sessions" el propio Chris Thomas recuerda que "Acababa de regresar de mis vacaciones, y cuando entré había una pequeña carta en el escritorio que decía:" Querido Chris: Espero que hayas tenido unas buenas vacaciones.

[5]​ La relación con Roxy Music se prolongó varios años más dando inicio a una colaboración que continuó con los siguientes cuatro álbumes; Stranded, Country Life, Siren y Viva!.

Pero afortunadamente, Chris era más comprensivo con mi punto de vista que con Roger".

[6]​ La intervención de Thomas dejó totalmente satisfechos a ambos músicos con el resultado final.

Durante los años 1990 trabajo con Pulp,[15]​ para los que produjo los álbumes Different Class y This Is Hardcore cosechando un enorme éxito con el sencillo "Common People" en 1995.