Inicio como juvenil en Servite High School, también jugó por el equipo de Irvine Strikers y por el UC Santa Bárbara Gauchos.
En marzo de 2009 marcó su primer gol en el empate 2 a 2 ante Los Angeles Galaxy.
[1] Fue elegido como el jugador más valioso en el Juego de las Estrellas de la Major League Soccer 2012, además marcando un gol.
En octubre de 2019 anunció su retirada tras diez años en la Major League Soccer.
[2] Pontius no ha jugado para la selección estadounidense a ningún nivel, pero ha sido convocado para entrenar con el primer equipo en varias ocasiones.