Duhon llegó a Duke en 2000, donde tuvo un notable rol de reserva del base Jay Williams.
Los Blue Devils ganaron el campeonato de la NCAA en 2001, y Duhon fue nombrado Rookie del Año en la Atlantic Coast Conference en 2001.
En su temporada sénior, Duhon firmó 10 puntos, 6 asistencias, 2.2 robos y 4.1 rebotes para llegar a otra Final Four.
Ya en su tercera temporada como profesional en la NBA, Duhon ha firmado 7.2 puntos y 4 asistencias en 78 partidos, 30 de titular.
Tras el Huracán Katrina, organizó la Chris Duhon Stand Tall Foundation para ayudar a los damnificados.