Fundado en 1993, es uno de los clubes profesionales más antiguos del país en estar vigentes, junto con el Richmond Kickers.

[2]​ Tras la salida de Ramsey en 2004, el club fue dirigido por el jugador y segundo entrenador Mike Anhaeuser.

En esa temporada 2010 en la tercera categoría, el Charleston lideró la clasificación por todo el año y consiguió una racha invicta como local.

Venció al Richmond Kickers por 2-1 en la final, ganando así su tercer título de liga.

[6]​[7]​[8]​ En febrero de 2016 Tony Bakker, dueño mayoritario del club anunció que el equipo fue vendido a B Sports Entertainment, además se confirmó que el presidente del club, Andrew Bell, y el entrenador Anhaeuser seguirán en su cargo.

[11]​ En octubre de 2019, se anunció que B Sports Entertainment había vendido el club a Rob Salvatore de HCFC, LLC con un traslado al Patriots Point Soccer Complex en Mount Pleasant.