Palihapitiya vive actualmente en California con su novia Nathalie Dompe, una heredera y modelo farmacéutica italiana.

En 2005, dejó AOL y se unió a Mayfield Fund; unos meses después dejó ese trabajo y se unió a Facebook, que entonces tenía poco más de un año.

Palihapitiya realizó inversiones paralelas mientras aún trabajaba en Facebook, incluidas inversiones en Palantir, Pure Storage, Playdom (adquirido por The Walt Disney Company) y Bumptop (adquirido por Google).

En 2011, dejó Facebook y comenzó su propio fondo, The Social + Capital Partnership, en compañía de su esposa.

[2]​ A través del fondo, Palihapitiya ha invertido en varias empresas, incluidas Glooko, Inc, Yammer, SecondMarket, Slack, Box y Premise.

Fue también en 2017, en el marco de una conferencia que estaba impartiendo en Stanford mostró públicamente su descontento por haber ayudado a Facebook a crecer y convertirse en la mayor red social del planeta: "Los lazos de retroalimentación a corto plazo impulsados por la dopamina que hemos creado están destruyendo la forma en que funciona la sociedad:[3]​ no hay discurso civil, no hay cooperación, solo desinformación y falsedades, y no es un problema estadounidense".