Los católicos de rito greco católico o eslovaco comenzaron a establecerse en Košice en el siglo XVII.
Fue 1852 que el obispo y la capilla fueron establecidos en Košice.
Hasta entonces, los servicios religiosos se realizaban en la iglesia de los Franciscanos, y rara vez en la Capilla de San Miguel.
En la era comunista de la antigua Checoslovaquia, se le cedió la Iglesia ortodoxa después de la prohibición de la iglesia católica griega (bizantina católica).
Después de 1990 fue devuelta a los católicos griegos y la iglesia fue reparada y restaurada a su condición actual.