En 1664, la condesa Sophie-Théodore zu Dohna-Schlobitten construyó una primera casa señorial en estilo neerlandés.

En 1691, Federico III, príncipe elector de Brandeburgo-Prusia y futuro rey en Prusia, adquirió este castillo por 16.000 táleros a la viuda del mariscal Grumbkow, con las vastas tierras que se extendían desde Pankow hasta Blankenfelde, al norte.

El nuevo rey hizo restaurar y ampliar el grupo de edificios en 1704; la obra fue dirigida por Johann Friedrich Eosander von Göthe.

Sin embargo, tras la muerte del rey en 1713, su sucesor Federico Guillermo I se preocupó poco por la casa.

Desde mediados del siglo XIX, Schönhausen estuvo cada vez más abandonado y sirvió únicamente como guarda muebles real.

[1]​ El castillo sufrió sólo ligeros daños durante los bombardeos aliados y la batalla de Berlín en 1945.

Allí acogió, entre otros, a Ho Chi Minh y Nikita Jrushchov.