Nació en Pitcairn, Pensilvania, de una familia con larga trayectoria musical.
Además del "Rainbow Bass", Claypool posee otras seis creaciones de Carl Thompson.
Los bajos Carl Thompson son muy buscados y él mantiene una lista de espera de dos años, aunque algunos encargos pueden tardar hasta tres años en completarse.
En la actualidad continúa como músico activo, practicando varias horas al día y tocando una vez a la semana en un restaurante local de Brooklyn.
Es un experto en el campo de la voz en el jazz, y es un entrenador vocal respetado de jóvenes cantantes, utilizando su impresionante colección de grabaciones viejas para ayudarles a madurar, visitando el pasado para que la maestría musical del siglo XX pueda ser pasada a generaciones futuras.