El Campeón de Campeones 1943-44 fue la III edición del Campeón de Campeones que enfrentó al campeón de la Liga 1943-44: Asturias y al campeón de la Copa México 1943-44: España.
El título se jugó a partido único realizado en el Parque Asturias de la Ciudad de México.
Al final de éste, el España consiguió adjudicarse por primera vez en su historia este trofeo.